Пятилетний Сосукэ находит на берегу маленькую рыбку, застрявшую в стеклянной банке. Он освобождает её и даёт имя Поньо. Для мальчика, живущего в прибрежном городке с мамой, это просто спасение крошечного существа. Но сама Поньо - дочь морского колдуна и богини, и её возвращение в океан запускает цепь событий, грозящих нарушить хрупкое равновесие мира. Она привязывается к Сосукэ и мечтает стать человеком, чтобы остаться с ним навсегда. Её желание оказывается сильнее законов природы, и за него
Железнодорожник служит на отдалённом участке, где кажется, что с окончанием путей завершается и его жизнь. Один день сменяет другой в бесконечной однообразности. В воспоминаниях мелькает прежняя жизнь, когда рядом была семья.
Июнь 1944 года. Четырнадцатилетний мальчик, охваченный патриотическим порывом, добивается зачисления в отряд юнг Императорского флота. Его учителя, выпускники лучших университетов Японии, ведут между собой спор. Они решают, что должно лежать в основе воспитания детей: строгая дисциплина или любовь. Спор остаётся философским. Подростки уже стоят на дороге, которая ведёт их к гибели. Вопрос о методах воспитания теряет смысл перед фактом, что этих детей готовят к смерти. Мальчик смотрит на мир,